南小岛，又称为蛇岛。面积约0.40平方千米，最高海拔139m。南小岛蛇多，简直遍布全岛，最大的有碗口粗，最小的则如小手指头细。蛇的颜色一 般以黄色、黑色居多，但都是无毒的。南小岛也许由于蛇太多，鸟类竟然绝迹。从远处海面望去，平坦的沙滩，绵延100余米，与另一处高达300米的陡峭山坡相接，组成一个气势雄伟、景色壮丽、山海相映的地貌景观，目前无人居住。此外，钓鱼诸岛由于风力太大，又缺乏淡水，因而没有蚊虫。北小岛和南小岛孤悬于海中，两岛相隔约200m，古时合称橄榄山。与钓鱼岛组成一个天然的“蛇岛海峡“。就地形观察，它们原为一个岛屿，后因断裂活动，地堑陷落，一岛分裂为二。虽然同源，但它们却各有特色。北小岛以鸟多著名。南小岛则以蛇多著称，南北小岛之间的海峡长约150m。在东海风浪大时，中国台湾、福建一带渔民会将船只驶于此一海峡以避风浪。